Se il terzo HD è l'unico su quel canale (Ata 66) lo dovresti mettere come master, non ho letto nella tua descrizione questa prova...
Dopodichè prova a riavviare, dopo aver visto almeno una volta "salire" il sistema operativo, magari c'è qualche autodiagnostica di controllo che se cambi configurazione si deve "ritrovare".
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