La butto lì un po' in fretta e con il rischio di bagliare...
Forse potresti intervenire con QuickTime Pro. Il procedimento è più o meno quello descritto qui:
http://www.tuttologia.com/tutorial/divx-dvd-idvd.html
Oppure...
con l'ottimo mpeg Streamclip. Sì io opetrei per quest'ultima soluzione.
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