Mi sembra che la cosa importante sia salvare i tuoi dati per poterli poi nuovamente salvare sul tuo HD esterno (inizializzato FAT 32) e poterlo così collegare al tuo Mac senza limitazioni. A cosa ti serve una doppia partizione?

questa è la procedura per inizializzare un HD con il Mac

http://www.tuttologia.com/basic/form...ializzare.html