Il procedimento che ti avevo indicato mirava appunto a salvare impostazioni e download. Veramente trovavi tutto con una ricerca sul forum...
1) tieni conto che la mia applicazione si chiama ancora Azureus (aggiornato alla v. 4.2.0.8; se per sbaglio ti interessa, la storia è spiegata
qui e
qui), per cui è possibile che alcuni nomi che ti indico sostituiscano Vuze ad Azureus.
2) dalla cartella ~/Libreria/Application Support/Vuze sposta sulla scrivania i file azureus.config e azureus.config.bak (file di backup del precedente) e salvi le impostazioni
3) sposta sulla scrivania la cartella dei download
4) cestina Vuze, la cartella ~/Libreria/Application Support/Vuze ed eventuali .plist che trovi in ~/Libreria/Preferences, come ti avevo già spiegato
5) scarica e installa la v. 4.2.0.8
6) riapri Vuze
7) rimetti a posto azureus.config o vuze.config (sovrascrivendo il nuovo file creato da Vuze) e la cartella download spostati sulla scrivania
8 ) prima di aggiornare a 4.0.3.x, leggiti prima un po' i commenti in rete finché sei su PowerPC.